Banyak faktor yang mempengaruhi kenyamanan dan kepuasan penumpang Transjakarta, termasuk keamanan terminal  terkait dengan banyaknya kejahatan di terminal seperti pencurian, pelecehan seksual dan kecelakaan. Hal-hal lain yang menghambat adalah waktu yang dibutuhkan penumpang untuk mencapai  terminal dari pintu masuk di ujung terjauh. Transit antar terminal sulit dan tidak praktis di mana penumpang yang ramai harus berdiri dalam antrian panjang di dalam koridor panjang yang menyebabkan mereka merasa tidak nyaman. Keandalan dan kenyamanan memiliki efek parsial pada kepuasan penumpang Transjakarta. Keamanan, keselamatan, dan kenyamanan tidak berpengaruh terhadap kepuasan penumpang Transjakarta (Silaningsih et al., 2015).