Pelabuhan yang diusahakan
Pelabuhan untuk memberi fasilitas yang diperlukan oleh kapal seperti, kegiatan bongkar muat barang, menaik turunkan penumpang. Pelabuhan tersebut dikenakan biaya jasa labuh, jasa tambat, jasa pemanduan, jasa dermaga, jasa bongkar muat, dll.
Pelabuhan yang tidak diusahakan
Pelabuhan yang hanya untuk persinggahan kapal tanpa fasilitas. Pelabuhan ini adalah pelabuhan kecil yang disubsidi oleh pemerintah dan dikelola oleh unit pelaksanaan tehnis. Contoh : Pelabuhan Banyuwangi, dan Pelabuhan Tobelo.
Fungsi Perdagangan Nasional dan Internasional
A. Pelabuhan Laut :
  Pelabuhan ini melayani angkutan laut dan angkutan penyebrangan;
B. Pelabuhan Sungai dan Danau:
HIERARKI PELABUHAN :
-Pelabuhan Utama;
-Pelabuhan Pengumpul