Tahun 1999, program pascasarjana membuka Magister Ilmu Hukum dengan konsentrasi Hukum Bisnis sebagai prodi baru.
Tahun-tahun berikutnya, pascasarjana membuka Magister Teknik Informatika (2003), Magister Teknik Arsitektur (2006), Magister Ilmu Komunikasi (2017), Magister Teknik Industri (2019).
Hingga tahun 2020, kini program pascasarjana memiliki sebanyak 7 program studi. Dalam perkembangannya, UAJY banyak bekerjasama dengan berbagai mitra seperti universitas atau lembaga pendidikan nasional maupun intenasional.
Kegiatan kerjasama dapat berupa pertukaran pelajar atau projek lainnya yang berkaitan dengan pembangunan karakter dan pendidikan.
Ade juga membahas bahwa di antara tujuh prodi, terakreditasi A oleh BAN-PT ada pada prodi Hukum, Manajemen, dan Aritektur. Terakreditasi B pada teknik informatika. Terakreditasi Sangat Baik (SB) pada prodi Teknik Sipil. Untuk Teknik Industri dan Ilmu Komunikasi belum terakreditasi karena masih baru dalam operasi pendidikan.
Kerjasama Pascasarjana UAJY, Libatkan Berbagai Instansi Internasional
Beragam bentuk kerjasama dilakukan oleh UAJY guna meningkatkan SDM dan kualitas pendidikan kampus. Berikut merupakan beberapa kerjasamanya:
- Microsoft Corporation: Penyediaan perangkat lunak bagi sivitas akademika untuk pelajaran daring melalui Ms. Teams.
- Technical University of Ilmenau: Pertukaran dosen Magister Ilmu Komunikasi dalam mengajar dan mahasiswa dalam belajar
- Ateneo de Manila University, Phillipines: Penelitian Dosen Magister Ilmu Komunikasi.
- IOS Developer Program API Agreement: Izin penggunaan layanan antarmuka software IOS
- Universitas Utara Malaysia dan Kansai University of International Study: Studi global dan Asian Cooperative Program (ACP) International Field StudiesÂ
- Providence University Taiwan: Pertukaran mahasiwa Magister Manajemen.
- D. l. l.
Jumlah Lulusan Pascasarjana UAJY
Telah berhasil menghantarkan sebanyak 1319 mahasiswa S-2, berikut jumlah lulusan atau alumni pascasarjana per prodi:
- Manajemen : 402 orang
- Teknik Sipil : 223 orang
- Hukum : 270 orang
- Informatika : 327 orang
- Arsitektur : 97 orang
Peluang Bekerja Setelah Pascasarjana
Menyebutkan bahwa mahasiswanya banyak yang menempuh pendidikan namun sudah bekerja, Lukas Ispandriarno membagikan cerita bahwa membangun networking di pascasarjana bukanlah hal yang sulit.Â