Melalui konfrontasi multipel dan bertahap (sampai puncak hierarki) dengan rangsangan yang menimbulkan rasa takut, pasien sekarang harus dibiasakan, yaitu tidak peka, terhadap reaksi rasa takut. Selain itu, perilaku agonis kecemasan diperkenalkan, seperti dalam counter-conditioning Mowrer, relaksasi otot progresif. Relaksasi otot progresif  dimulai segera setelah pasien menjadi takut dalam imajinasi stimulus yang memicu rasa takutnya.
Desensitisasi sistematis dapat dikritik karena fakta  prosedur, yang biasanya terdiri dari enam hingga dua belas sesi, ditambah dengan otot progresif, memang bekerja melalui hierarki ketakutan secara bertahap, tetapi pasien kemudian belum tentu sembuh dari fobianya. Pasien hanya belajar melalui rekondisi dari rasa takut ke relaksasi untuk dapat menghadapi situasi yang memicu rasa takut ini dengan lebih baik. ****