    Tentu saja pinjam buku di Perpustakaan Atma Jogja juga memiliki prosedur nya sendiri. Pinjam buku maksimal 6 buah, dengan batas peminjaman tujuh hari saja. Adanya mesin dan petugas, mengurangi jumlah antrian dalam peminjaman buku.
"Kalo dibiarkan mandiri semua akan menyebabkan antrian panjang, tapi mungkin nanti kedepannya juga akan dilaksanankan peminjaman mandiri semua," ujar Bapak Anton selaku Petugas Perpustakaan Atma Jogja.
3. Â Â Â Mengembalikan dengan waktu yang tak terbatas
Ada mensin canggih untuk meminjam buku, ada pula mesin canggih untuk mengembalikan buku. Mesin tersebut berada di luar perpustakaan, tepatnya di  selasar depan Perpustakaan Atma Jogja. Cara mudah untuk mengembalikan buku dengan menempelkan barcode buku pada mesin tersebut loker akan terbuka masukkan buku dan akan tercetak struk sah pengembalian buku.
Adanya mesin tersebut semakin memudahakan untuk mengembalikan buku kapan saja. Pasalnya, sebelum ada mesin tersebut pengembalian buku hanya dilakukan oleh petugas di dalam perpustakaan sesuai dengan jam kerja. Jam kerja Perpustakaan Atma Jogja yakni Senin - Jumat pukul 08.00 - 19.00, sedangkan Sabtu pukul 08.00 - 12.00 saja.Â
Apabila menggunakan mesin tersebut, buku dapat dikembalikan hari apa saja hingga Kampus IV UAJY tutup. Akan tetapi yang perlu diingat adalah maksimal peminjam buku hanya seminggu. Jadi bila lebih dari seminggu akan dikenakan denda Rp 500/hari.
4.    Mengecek peminjaman buku perpustakaan  secara online
    Civitas Atma Jogja atau bahkan semua orang dapat mengecek ketersedian buku yang ada di Perpustakaan UAJY dari mana saja melalui situs http://catalog.lib.uajy.ac.id/.Â
Demikian, jika tidak sempat untuk datang ke Perpustakaan dapat mengeceknya melalui situs tersebut. Kemudahan ini memiliki manfaat satu lagi, apabila tidak ada buku yang dicari, maka tak perlu pergi ke Perpustakaan Atma Jogja untuk meminjam. Orang akan menghemat perjalanannya dengan situs ini.
    Apabila buku yang dicari ada, namun masih dipinjam orang lain. Calon peminjam juga akan mengetahui kapan buku tersebut akan kembali. Sehingga bisa datang ke Perpustakaan Atma Jogja saat buku sudah kembali.
