Saat Bane melakukan aksi, Bruce tidak punya pilihan lain, selain muncul kembali sebagai Batman. Alat khusus dari Lucius Fox (Morgan Freeman) untuk kaki kiri Bruce, membantunya untuk bisa berdiri dengan baik kembali.
Meskipun sebelumnya, dia sempat nego dengan Gordon supaya Batman tidak kembali lagi, namun apa mau dikata. Tak ada yang bisa menghentikan Bane, selain Batman. Begitu kata Jim Gordon, yang sekarang naik pangkat menjadi komisaris polisi. Polisi tak berdaya menghadapi Bane.
Namun, Batman tak berhasil menggagalkan upaya Bane untuk 'mengkerdilkan' Bruce Wayne. Malah seperti jatuh, tertimpa tangga, Alfred (Michael Caine) meninggalkan Bruce, karena dia tidak ingin Bruce kembali menjadi Batman dan tewas. Dia tidak ingin menguburkan Bruce dan dia tidak mau merasa bersalah seumur hidup kepada mendiang orangtua Bruce karena tidak bisa menjalankan tugas untuk menjaga Bruce.
Bruce pun terpaksa bergerak sendiri. Dia menghubungi Selina Kyle (Catwoman) supaya menunjukkan dimana Bane berada. Kyle meminta program penghapusan catatan kriminal, dan Bruce pun menyanggupi. Sayangnya, Kyle malah menempatkan Batman dalam jebakan Bane.
Pertarungan yang sengit, namun Bane menang di babak ini. Tulang punggung Batman patah dan identitasnya pun diketahui oleh Bane dan juga Catwoman.
Bane membuang Bruce ke penjara dengan nama 'dunia gelap', penjara dimana Bane dulu ditahan.Â
Bane pun merasa bebas, bebas untuk melaksanakan misi dari mantan bosnya, R'as Al Ghul, untuk menghancurkan Gotham. Dimulai dengan mengebom lapangan rugbi dan jembatan-jembatan penghubung ke kota lain, mengaktifkan bom nuklir, dan menguasai kota dengan menebar teror, dan melakukan pengadilan yang aneh untuk orang-orang kaya yang dianggap tidak pro dengan warga menengah ke bawah.
Sementara Bruce berusaha untuk memulihkan kondisinya kembali, supaya dia bisa keluar dari penjara itu, dan kembali ke Gotham untuk menyelamatkan kota itu dari tirani Bane.
Setelah hampir putus asa, Bruce pun akhirnya berhasil keluar dari penjara itu, dan membantu tahanan-tahanan lain untuk keluar pula.
Batman bangkit kembali. Bane pun nyaris tak percaya. Dibantu oleh polisi-polisi Gotham, Batman memerangi Bane dan komplotannya. Batman pun menemukan Miranda Tate.
Kejutan terjadi waktu Batman sudah menaklukkan Bane dan Batman menanyakan dimana Bane menyimpan detonator bom itu. Batman yakin Bane tak mungkin mempercayai orang lain, dan Batman sudah sangat yakin kalau Bane adalah anak dari R'as Al Ghul yang bisa lolos dari dunia gelap tadi.
