Maverick dianggap melanggar perintah dengan apa yang sudah digariskan untuk dilakukan. Namun akhirnya mereka berhasil mendarat dengan selamat di kapal induk.Â
Komandan USS Enterpise, Tom "Stinger" Jardian (James Tolkan) tak suka dengan  kecerobohan Maverick.  Tetapi Maverick diberikan kesempatan sekali lagi masuk sekolah  di Top Gun Naval Fighter Weapons School , bergabung dengan pilot-pilot pesawat tempur yang terbaik di sana.
Latihan-latihan berat dengan manuver yang sangat membahayakan , membuat kemampuan mereka makin hebat dan mampu  bermanuver tajam.
Untuk mengurangi ketegangan latihan,  sebelumnya Maverick dan Goose datang  ke sebuah bar.
Di sana mereka bertemu dengan seorang perempuan cantik bernama Charlotte "Charlie" Blackwood (Kelly McGillis).
Maverick baru menyadari bahwa Charlie adalah seorang astrofisikawan dan instruktur di TOPGUN.
Pada pandangan pertama Charlie langsung jatuh cinta kepada Maverick, apalagi Charlie melihat dengan kagum manuver Maverick yang sangat hebat dan menantang itu.
Pada saat  latihan pertamanya, Maverick mampu mengalahkan instrukturnya sendiri Rick "Jester" Heatherly (Michael Ironside).
Jester menggagumi manuver dan keahlian Maverick. Â Sayangnya, justru Maverick dianggap terlalu sembrono dalam latihan dan melanggar aturan yang sudah ditentukan oleh kepala instruktur Mike "Viper" Metcalf (Tom Skerritt).
Tapi Maverick tak bisa bergeming ketika saingannya Tom "Iceman" Kazanky (Val Kilmer) sangat benci kepadanya.
Perseteruan Maverick dengan atasan dan rekan sering terjadi di tempat pelatihan TOPGUN.
