Setelah melakukan perenungan untuk memantapkan hati, maka di saat beliau berusia 17 tahun dan masih duduk di bangku SMA, beliau putuskan untuk memeluk agama Islam. Oleh K.H.Abdullah bin Nuh al-Ghazali beliau dibimbing untuk mengucapkan ikrar dua kalimat syahadat pada tahun 1984. Nama beliau kemudian diganti menjadi Syafii Antonio.
Keputusan yang beliau ambil untuk menjadi pengikut Nabi Muhammad saw. Ternyata mendapat tantangan dari pihak keluarga. beliau dikucilkan dan diusir dari rumah. Jika beliau pulang, pintu selalu tertutup dan terkunci. Bahkan pada waktu shalat, kain sarung beliau sering diludahi. Perlakuan keluarga terhadap diri beliau tak beliau hadapi dengan wajah marah, tapi dengan kesabaran dan perilaku yang santun. Ini sudah konsekuensi dari keputusan yang saya ambil.
Alhamdulillah, perlakuan dan sikap beliau terhadap mereka membuahkan hasil. Tak lama kemudian mama menyusul jejak beliau menjadi pengikut Nabi Muhammad saw.
Setelah mengikrarkan diri, beliau terus mempelajari Islam, mulai dari membaca buku, diskusi, dan sebagainya. Kemudian beliau mempelajari bahasa Arab di Pesantren an-Nidzom, Sukabumi, dibawah pimpinan K.H.Abdullah Muchtar.
Lulus SMA beliau melanjutkan ke ITB dan IKIP, tapi kemudian pindah ke IAIN Syarif Hidayatullah. Itupun tidak lama, kemudian beliau melanjutkan sekolah ke University of yourdan (Yordania).
Selesai studi S1 beliau melanjutkan program S2 di international Islamic University (IIU) di Malaysia, khusus mempelajari ekonomi Islam. Selesai studi, beliau bekerja dan mengajar pada beberapa universitas. Segala aktivitas beliau sengaja beliau arahkan pada bidang agama. Untuk membantu saudara-saudara muslim Tionghoa, beliau aktif pada Yayasan Haji Karim Oei. Di yayasan inilah para mualaf mendapat informasi dan pembinaan. Mulai dari bimbingan shalat, membaca Al-Qur'an, diskusi, ceramah, dan kajian Islam, hingga informasi mengenai agama Islam.
http://www.scribd.com/doc/506978/syafii-antonio