Setelahnya Yansen TP naik jabatan sebagai Sekretaris Daerah Kabupaten Malinau dari tahun 2002 hingga 2009. Dan sejak 2009 hingga 2011 dipercaya sebagai Staf Ahli Gubernur Bidang Hukum, Politik, dan Pemerintahan, serta Staf Ahli Gubernur Bidang Ekonomi dan Keuangan Kalimantan Timur.
Selama memangku berbagai jabatan penting birokrasi, Yansen TP masih terus belajar dengan menamatkan pendidikan Magister Ilmu Administrasi Negara Universitas Brawijaya Malang pada tahun 2002, dan meraih gelar Doktor pada tahun 2011 di Fakultas Ilmu Administrasi Negara Universitas Brawijaya Malang.
Perhatian Besar Yansen TP kepada Kemajuan Peradaban Kalimantan
Yansen Tipa Padan menaruh perhatian besar kepada kemajuan peradaban di Kalimantan Utara. Ketika masih menjabat sebagai Bupati Malinau, Yansen TP membuat model pembangunan yang diberikan nama GERDEMA (Gerakan Desa Membangun).
Yansen TP mengalokasikan sebagian besar penggunaan APBD untuk membuka jalan di pedalaman. Dia juga mendorong provider untuk membangun tower untuk membantu jaringan komunikasi dan kegiatan sosial.
Perhatian khusus diberikan Yansen TP kepada dunia literasi Yansen TP. Dia aktif melakukan pelatihan Pegiat Literasi Desa di kawasan Kalimantan Utara.
Dalam sudut pandang Yansen TP, literasi adalah jembatan untuk maju kepada masyarakat di pelosok perbatasan. Karena dengan membaca literatur dapat membuka wawasan pemikiran baru yang memajukan peradaban di Kalimantan Utara.
Kegiatan Writing Camp di Krayan tersebut sebagai upaya  memfasilitasi interaksi antara pegiat literasi nasional dengan masyarakat Dayak di kawasan perbatasan Kalimantan Utara.
Fe Milau dipilih sebagai tempat Writing Camp karena tempat itu memiliki nilai historis besar bagi Yansen Tipa Padan. Mantan Bupati Malinau tersebut ingat betul kawasan hutan Fe Milau adalah jalur jalan yang dilaluinya bersama keluarganya pada tahun 1970 silam ketika pindah ke Malinau.
