Pada awal babak kedua PSM Makkasar mulai megubah pola permainan dan melakukan serangan. Bermain dengan sepuluh pemain PS Sleman tetap tampil percaya diri. Menit ke 54+2 serangan balik PSS lewat Irfan Jaya yang memberikan umpan manisnya keda Rafi Angga, sayangnya tendangannya masih bisa ditepis oleh penjaga gawang Hilmanysah.
Bermain unggul dengan sebelas pemain membuat PSM Makkasar terus melakukan serangan. Menit ke 58 tendangan bebas yang dieksekusi oleh Sutanto Tan berhasil membobol gawa Miswar Saputra. Dengan demikian PSM Makkasar berhasil menyamakan kedudukan dengan skor sementara 1-1.
PS Sleman melakukan rotasi pemain dengan memasukan Nico Velez dan Arsyad Yusgiantoro yang menggantikan sang pelari cepat Irfan Jaya. Dengan dimasukkanya kedua pemain ini tentu saja akan menambah daya gedor lini depan PS Sleman.
Menit ke 65 Nico Velez yang baru saja dimasukkan berhasil memberikan umpan manis kepada Irkham Mila yang kemudian membuahkan gol lewat tendangan kerasnya yang tidak bisa dihalang oleh Hilmansyah.
Pada menit ke 72 tendangan first time Saldy dari dalam kotak pinalti berhasil diamankan oleh penjaga gawa PS Sleman. Tidak mau kalah menit 73 tendangan bebas Rafi Angga mengarah ke pojok tiang gawang namun berhasil ditepis oleh Hilmansyah.
PSM Makkasar terus mecoba menyerang menembus rapatnya pertahanan lini belakang PS Sleman. Enam menit tambahan waktu babak kedua diberikan, PSM Makkasar terus mengurung lini belakang PSS. Pada menit ke 93 PSM Makkasar mendapatkan peluang emas lewat tendangan pemain depanya yang melakukan tendagan keras dan sayangnya masih berhasil ditepis oleh Miswar.
Hingga peluit akhir babak kedua dibunyikan PS Sleman tetap unggul dengan skor 2-1 atas PSM Makkasar.
Dengan demikian PS Sleman berhasil mengalahkan PSM Makkasar dan menjadi juara peringkat ketiga Piala Menpora 2021.
