Pada tahun 1987, Haftar ditawan oleh Chad setelah berhasil dipancing ke dalam perangkap, sehingga mempermalukan Khadafi. Saat ditawan, ia bersama dengan perwira-perwira lainnya membentuk kelompok yang ingin menjatuhkan Khadafi.
Pada tahun 1990, Haftar dilepaskan pada tahun 1990 berkat persetujuan dengan pemerintah AS dan lalu menghabiskan waktu selama dua dasawarsa di Langley, Virginia, dan mendapat kewarganegaraan AS. Haftar hidup dengan nyaman di Virginia (relatif dekat dengan marks CIA) dari tahun 1990-an hingga tahun 2011. Pada tahun 1993, diadakan pengadilan "in absentia" di Libya yang menjatuhkan vonis hukuman mati atas tuduhan kejahatan terhadap Jamahiriya.
Haftar memegang jabatan senior di dalam kepemimpinan pasukan yang menjatuhkan Khadafi selama Perang Saudara Libya pada tahun 2011. Pada tahun 2014, ia menjadi komandan Angkatan Darat Libya setelah Kongres Nasional Umum (GNC) menolak menyerahkan kekuasaan pada akhir masa jabatannya. Haftar melancarkan kampanye militer melawan GNC dan sekutu-sekutunya yang berhaluan Islam fundamentalis. Akibatnya, terjadinya Perang Saudara Libya Kedua.
Nama Muammar Khadafi dikenal dunia sebagai pemimpin diktator di Libya yang terhitung sebagai penguasa negara dengan sistem non-kerajaan terlama sejak Abad 20. Ia memimpin Libya hingga 41 tahun. Khadafi menyebut dirinya sebagai 'the Brother Leader', 'Guide of the Revolution', dan 'King of Kings (Raja segala raja).
Kepemimpinan dengan waktu kekuasaan yang lama tersebut bermula dari hari ini, 48 tahun silam, 15 Januari 1970. Pada hari itu, Khadafi memproklamirkan diri sebagai Perdana Menteri Libya yang didukung Dewan atau Kongres Rakyat, badan sejenis DPR/MPR, setelah mengkudeta Raja Idris pada September 1969.
Kamis, 20 Oktober 2011 menjadi hari terakhir bagi Muammar Khadafi menghirup udara segar. Pemimpin Libya yang telah berkuasa selama 42 tahun, 1969-2011, menemui ajalnya, Ia tewas di tangan pasukan oposisi yang disebut tentara Transisi Nasional Libya (NTC).
Sekarang yang memimpin Libya, adalah Nouri Abusahmain. Ia adalah adalah politikus Libya yang menjabat sebagai Presiden Kongres Nasional Umum Libya sejak 25 Juni 2013. Ia juga merupakan wakil dari kota Berber, Zuwarah, yang terletak di barat negara itu. Sekarang pemerintahannya sedang menghadapi kemelut. Sudah banyak yang jatuh korban. Diduga ia juga dibantu gerilyawan ISIS (Negara Islam di Irak dan Suriah) yang berada di Afrika.