2. Sistem ERP biasanya sulit beradaptasi dengan alur pekerjaan dan pengoprasian dalam perusahaan.
3. Perusahaan terkadang hanya  memikirkan manfaat yang besar dari sistem ERP tanpa mempersiapkan pekerjanya.
Perusahaan -- perusahaan yang menggunakan aplikasi ERP
1. Telkomsel
PT telkomsel adalah perusahaan yang menerapkan sistem ERP .Enterprice Resource Planning (ERP) membantu perusahaan dalam produksi, penjualan, sumber daya manusia, finansial dan lain-lain yang terintegrasi dengan satu arsitektur teknogi informasi. Sistem yang digunakan yaitu SAP R/3 Enterprise.
2. PT. Semen Gresik
Sistem ERP mendukung bisnis proses yang ada di Semen Gresik dengan penerapan pertama kali dilakukan di bagian finansial. Dengan berjalannya waktu, penerapan dilakukan di bagian penjualan dan kemudian di bagian manufakturing. Sistem yang digunakan yaitu ERP JD Edwards.
3. Garuda Indonesia
Karena perkembangan bisnis sangat pesat mengharuskan PT Garuda Indonesia mengoptimalkan kinerja tiap divisi agar kinerja dapat optimal dengan baik .Sistem yang digunakan yaitu SAP.
4. PT. Astra Argo Lestari
Program ERP yang digunakan adalah Oracle untuk memproses semua data yang berhubungan dengan sistem yang dimiliki oleh perusahaan tersebut. Perusahaan tersebut menggunakan Oracle 9.i dan Oracle 10.i perusaahaan tersebut menggunakan sistem tersebut  untuk kepentingan database servernya.
