MTs Negeri  16 dibawah  pimpinan Drs Sutriyanto mengalami perkembangan yang baik, khususnya dalam bidang non akademik Pencak Silat. Dalam usia 27 tahun ( 25 nop 1985 - 25 nop 2022 ) semakin meningkatkan pengembangan bidang akademik.
Pada awalnya MTs Negeri 16 Jakarta merupakan perubahan dari MTs Negeri 6 Cawang Jakarta Timur yang beralamat di Jalan Gading Raya IPisangan Timur  Kecamatan Pulogadung Jakarta Timur.
Dengan visi menigkatkan  kemampuan imtaq  dan iptek, saat ini MTs Negeri 16 Jakarta mengembangkan kemampuan  siswa di bidang publikasi dan keagamaan . Semoga MTs Negeri 16 Jakarta semakin jaya dan berkembang dikancah  Madrasah  DKI Jakarta.
