Integritas adalah kualitas kejujuran dan prinsip moral di dalam diri seseorang yang dilakukan secara konsisten dalam kehidupannya secara menyeluruh. Integritas merupakan salah satu nilai budaya kerja Kementerian Agama Republik Indonesia dari empat lainnya profesionalitas, inovasi, tanggung jawab dan keteladanan. 5 nilai budaya kerja merupakan tolok ukur bagi para warga madrasah dalam menjalankan aktifitas pada masing-masing di lembaga.
Kata ''integritas''berasal dari Bahasa Latin, yaitu ''integer'' yang mengandung arti; keteguhan sikap dalam mempertahankan prinsip yang menjadi landsan hidup dan melekat pada diri seseorang sebagai nilai-nilai moral dan mutu, sifat, atau keadaan yang menunjukkan kesatuan yang utuh sehingga memiliki potensi dan kemampuan yang memancarkan kewibawaan, kejujuran, dan jati diri seseorang.
Integritas  yang telah ditanam di Madrasah Tsanawiyah Negeri 4 Flores Timur terus ditingkatkan sebagai ujud realisasi 5 nilai budaya kerja kementerian agama khususnya yang selalu bertekad dan mempunyai kemauan keras untuk berbuat baik dan benar, disiplin dan sungguh-sungguh dalam melaksanakan tugas Negara dan tepat waktu dalam menyelesaikan tugas yang diberikan.Â
Seorang warga madrasah yang memiliki integritas tinggi akan bertindak secara konsisten dan utuh, baik dalam perkataan dan perbuatan sesuai dengan nilai-nilai dan kode etik. Sebagai warga madrasah dianggap berintegritas ketika ia memiliki kepribadian dan karakter seperti, jujur dan dapat dipercaya, memiliki komitmen, bertanggung jawab, menepati ucapannya, setia, menghargai waktu, dan memiliki prinsip dan nilai-nilai hidup.
 Budaya integritas terus di tumbuhkembangkan di taman madrasah yang merupakan aset pendidikan Islam di  lewo tokan Witihama, bagi seluruh civitas akademika. Apa yang telah di raih dimasa silam yang menoreh prestasi gemilang, terus diperjuangkan dan dipertahankan, agar eksistensi madrasah ini tetap menjadi idola masyarakat Flores Timur khususnya Witihama Adonara. Kendati demikian, kerja sama yang solid dari segala lini, juga menjadi perioritas dalam capain  penghargaan lain di masa kini dan yang akan datang.
Bukan tanpa alas an, semua pihak agar menjaga marwah dan kehormatan madrasah, karena pada setiap momentum baik akademik maupun non akademik dari waktu ke waktu MTsN 4 Flotim selalu mendapatkan prestasi yang gemilang kendatipun pihak madrasah terus berproses untuk meningkatkan pelayanan dalam meningkatkan mutu pendidikan dan usaha pengembangan menjadi madrasah hebat bermartabat.
