Sistem pembayaran kapitasi untuk FKTP saat ini telah diterapkan sistem KBK dimana tujuannya untuk meningkatkan mutu pelayanan primer di FKTP dengan harapan peningkatan efisiensi dan efektifitas penyelenggara pelayanan kesehatan saat ini .
Penerapan KBK ini tentunya harus memenuhi beberapa indikator yg telah diatur oleh BPJS terhadap FKTP yg tentunya berlaku untuk semua FKTP termasuk FKTP TNI
Penerapan KBK di FKTP TNI saat ini memiliki kendala diantaranya :
1. Untuk peningkatan angka kontak di FKTP TNI yg pesertanya merupakan terdiri dari berbagai satuan di TNI dan ASN sulit untuk mendatangkan peserta tersebut ke klinik untuk pelaksanaan preventi dan edukatif sehubungan dengan tugas disatuan yg berbeda ( perijinan ke luar satuan )
2.Pasien yg berkunjung ke klinik TNI kebanyakan pasien rutin berobat, sedangkan dalam pemenuhan kbk kunjungan pasien seseorang yang lebih dari 1 kali kunjungan dihitung sebagai 1 kunjungan
3. Lokasi klinik TNI yang merupakan area perkantoran dan bukan merupakan area tempat tinggal sulit untuk mengadakan kegiatan home visit
4. Terbatasnya tenaga dokter dan paramedic untuk melaksanakan kegiatan penyuluhan sementara kegiatan pelayanan poli harus tetap berjalan
5. Keterbatasan tenaga administrasi dalam pemasukan kontak sakit dan kontak sakit sehat perhari dalam program p- care bpjs
Beberapa kendala penerapan kbk di FKTP TNI diatas mungkin dapat dijadikan pertimbangan dan kebijakan dalam penerapan kbk di FKTP TNI