Negara Indonesia dalam persebaran fauna dibagi menjadi tiga wilayah atau zona antara lain Fauna Australia, Fauna Transisi, dan Fauna Asia. Pembagian ini dikemukakan oleh pakar dari Negara Inggris yang bernama Alfred Russel Wallace. Beliau bertempat lahirkan di Inggris pada tanggal 8 Januari 1873.
Beliau melakukan penelitian di Negara Indonesia pada tahun 1854 sampai dengan tahun 1862. Penelitian yang dilakukan yaitu dengan mengelompokkan Fauna di Indonesia menjadi dua kelompok antara lain kelompok barat serta kelompok timur oleh garis pembagi yang dinamakan Garis Wallace.
A. Fauna Asia
Wilayah barat Indonesia merupakan bagian untuk Fauna Asia seperti terletak di daerah Kalimantan, Jawa, Madura, Bali, dan Sumatera. Hal ini dibuktikan dengan adanya satwa seperti badak jawa, harimau sumatera, macan tutul, dan masih banyak lainnya.
B. Fauna Transisi
Wilayah tengah Indonesia merupakan bagian untuk Fauna Transisi seperti terletak di daerah NTT, NTB, Sulawesi, dan Kepulauan Maluku. Hal ini dibuktikan dengan adanya satwa seperti komodo, burung maleo, anoa, dan masih banyak lainnya.
C. Fauna Australia
Wilayah timur Indonesia merupakan bagian untuk Fauna Australia seperti terletak di daerah Kepulauan Maluku bagian Utara dan Papua.
Hal ini dapat dibuktikan dengan adanya satwa seperti kangguru, burung cenderawasih dan burung kakak tua.