Melihat letak dan keunikannya, Danau Sidihoni dan Danau Aek Natonang merupakan sepasang pesona alam nan langka di Indonesia, bahkan dunia. Penyebabnya, dua danau ini terletak di atas danau kaldera terbesar di dunia.
Jika akses sarana transportasi dan infrastruktur pendukung dapat dioptimalkan, Danau Sidihoni dan Danau Aek Natonang bisa menjadi satu destinasi wisata alam unik, yang juga bisa mendatangkan lebih banyak manfaat bagi warga sekitar.
Mengingat posisi keduanya sebagai obyek wisata alam, hal lain yang perlu diperhatikan adalah bagaimana menjaga kelestarian lingkungan, termasuk mengelola danau di puncak musim kemarau, masa dimana danau rawan mengalami kekeringan. Jangan sampai, perkembangan pariwisata yang ada justru merusak lingkungan.
Danau Sidihoni dan Danau Aek Natonang memang hanya dua dari sekian banyak destinasi wisata di seputaran Danau Toba.
Tapi, keduanya  menjadi satu alasan, mengapa Danau Toba ditetapkan pemerintah, dalam hal ini Kementerian Pariwisata dan Ekonomi Kreatif (Kemenparekraf) menjadi satu "Destinasi Super Prioritas" (DSP) dalam wadah program "Wonderful Indonesia", Heritage of Toba, MICE di Indonesia Aja, dan DSP Toba.
Danau Toba memang hadir dari letusan supervolcano Gunung Toba sekitar 74.000 tahun silam, letusan gunung berapi terdahsyat yang pernah diketahui umat manusia.
Daya hancurnya memang luar biasa, tapi jejak fenomena alam ini telah meninggalkan satu keajaiban alam istimewa dalam wujud Danau Toba di masa kini. Keajaiban itu semakin istimewa, karena Danau Toba punya "keajaiban alam di atas keajaiban alam" berupa Danau Sidihoni dan Danau Aek Natonang, dua "danau di atas danau" , yang hanya ada di Danau Toba.
