Sekolah membangun fokus sistem tersendiri
Tanggung jawab yang besar oleh belajar
Strategi pembelajaran yang inovatif
Evaluasi yang berkelanjutan
Kurikulum yang terintegrasi
Pelibatan  orang tua dalam pengelolaan sekolah.[3]
Pengelolaan Lembaga Pendidikan dari segi persfektif madrasah menjelaskan manajemen berbasis madrasah dilakukan sebagai proses usaha bersama dengan  mendayagunakan  berbagai sumberdaya madrasah baik personal maupun material secara efektif  dan efisien guna mewujudkan tujuan madrasah  secara optimal. Hal ini dapat dibuktikan dengan  aktivitas  di madrasah perlu  proses  pengelolaan madrasah yang lebih efektif. Pengelolaaan manajemen madarasah yang efektif dilakukan dalam rangka mewujudkan kualitas mutu Pendidikan madrasah yang lebih mulia  dengan mlakukan kerja keras serta upaya yang lebih tinggi sehingga mampu menghasilkan sistem pengelolaan madrasah dengan kualitas lebih baik di masa depan.[4]
Kemampuan madrasah  dalam menata organisasi  didalamnya  sangat ditentukan oleh  kemampuan manajemen yang dilakukan untuk proses perubahan  lingkungan yang dihadapi mampu membuat madrasah bertahan di tengah perkembangan zaman yang  lebih menangtang sehingga perubahan akan menciptakan sistem baru yang berkualitas dengan sumber daya yang optimal dan mampu menciptakan pola perubahan yang besar dalam sistem pngelolaan madrasah  dari waktu ke waktu. Eksistensi madrasah memberikan pola  pengelolaan Lembaga  yang berbeda dalam dunia Pendidikan. Â
Keberadaan madrasah sebagai Lembaga Pendidikan saat ini masih belum bisa memberikan dampak yang signifikan dalam pngelolaan Lembaga madrasah hal ini dikuatkan dengan rendahnya mutu yang ada di lingkungan sekolah sehingga madrasah belum bisa  bersaing dengan Lembaga sekolah.  Persoalan tersebut dapat diselesaikan jika madrasah mampu menciptakan pola  peningkatan kualitas mutu yang dilakukan secara terus menerus sehingga madrasah mampu menjadi Lembaga Pendidikan yng lebih menonjolkan nilai keislaman  sebagai nilai lebih dalam sistem pengelolaan Lembaga Pendidikan.
 Pengelolaan madrasah yang efektif harus mempunyai paeran yang strategis dalam meningkatkan performa madrasah. Madrasah sebagai Lembaga Pendidikan yang  berbasis islam belum  mampu  menandingi kualitas sekolah negeri. Hal ini dibuktikan dengan pandangan yang masih menganggap madrasah sebagai kelas kedua dalam Lembaga Pendidikan di Indonesia. Maka, madrasah diharapkan mampu meningkatkan kualitas pengeelolaan Pendidikan yang ada melalui keterlibatan semua komponen madrasah dalam mewujudkan mutu yang berkualitas dalam pelaksanaan kebijakan yang berkaitan dengan aspek yang ada di madrasah. Madrasah harus bisa menyesuaikan dan beradaptasi secara lebih mendalam dalam peningkatan mutu  yang berbasis madrasah sehinggga pengelolaan yang ada mampu menciptakan sistem madrasah yang efisien dan efektif.[5]
 Pengaruh pengelolaan Lembaga Pendidikan  berbasis pesantren memliki peran yang sangat besar dalam meningkatkan mutu Pendidikan yang ada. Pesantren sebagai Lembaga Pendidikan islam mempunyai program pembelajaran yang tradisional, unik, dan berbeda dari yang lain. Pesantren sebagai Lembaga Pendidikan mnekankan bagaimana nilai keislaman yang ada dapat diajarkan dengan baik melalui kurikulum yang menekenkan nilai keislaman secara lebih matang dan teraarah sehingga peradaban islam terjaga dengan baik dan mampu memberikan bukti yang nyata dalam kualitas Pendidikan islam. Â