COVID-19 adalah virus yang penyebarannya sangat cepat. Pandemi ini memberikan dampak yang besar terhadap kehidupan manusia, salah satunya dalam bidang pendidikan. Pandemi saat ini belum selesai sehingga lembaga-lembaga pendidikan dituntut untuk mengikuti perubahan dalam menghadapi pandemi ini. Pada masa pandemi ini tidak memungkinkan untuk melaksanakan pembelajaran secara tatap muka. Demikian pula dengan mahasiswa/i Universitas Aisyiyah Yogyakarta yang melaksanakan pembelajaran secara online.
Universitas Aisyiyah Yogyakarta berperan penting dalam mencegah pemaparan virus Covid-19. Pada Sabtu 27 Maret 2021 UNISA Yogyakarta bersama Dinas Kesehatan Daerah Istimewa Yogyakrta  dan Majlis Pembina Kesehatan Umum (MPKU) Pimpinan Wilayah Muhammadiyah (PWM) Daerah Istimewa Yogyakarta melaksanakan vaksinasi di Kampus Terpadu UNISA Yogyakarta. Dengan jumlah peserta sebanyak 1.350 orang yang terdiri dari dosen dan tenaga kependidikan universitas Aisyiyah Yogyakarta, guru dan tenaga PAUD, TK, SD/MI, SMP/MTS, Muhammadiyah/Aisyiyah se-Daerah Istimewa Yogyakarta. Rektorat UNISA Yogyakarta mengatakan "Vaksinasi tidak hanya memberikan perlindungan kepada diri sendiri, tetapi kita juga memberikan perlindungan untuk orang lain disekitar kita".
Pada 25-28 Agustus 2021 UNISA Yogyakarta mengadakan vaksinasi kembali sebagai bentuk komitmen membantu pemerintah melakukan vaksinasi untuk masyarakat dengan upaya memutuskan rantai penyebaran Covid-19. Kegiatan vaksinasi ini berkerja sama dengan TNI Polri dengan kuota 6.500 peserta untuk dosis pertama.
Rektor UNISA Yogyakarta, Warsiti, S.Kp.,M.Kep.,Sp.Mat menyampaikan bahwa kegiatan ini adalah salah satu bentuk kontribusi nyata UNISA Yogyakarta untuk mendukung program vaksinasi Covid-19 DIY. Hal tersebut dilakukan untuk menurunkan angka kesakitan dan kematian karena Covid-19. Dan UNISA Yogyakarta juga menyediakan ruang isolasi di asrama kampus UNISA Yogyakarta yang berlokasi di Jl. Siliwangi Gamping Sleman. Menyediakan 50 kamar, ambulans 24 jam, pendamping psikolog, dan berbagai alat untuk mendukung isolasi mandiri. Ruang isolasi ini dibuka untuk masyarakat umum yang terpapar Covid-19.
Selain mengadakan vaksinasi massal, UNISA Yogyakarta juga membagikan hand sanitizer untuk mendukung sektor pariwisata khususnya di Yogyakarta. Yang bertujuan untuk mensosialisasikan gerakan 3M dan penerapan protokol kesehatan. Beberapa titik lokasi yang dikunjungi diantaranya kawasan Parkiran Ngabean, Pasar Ngasem, Area Kraton, Tamanasari, Abu Bakar Ali, Malioboro, dan Area Alun-Alun Utara. Dan beberapa webinar yang berkaitan dengan pandemi Covid-19. Dengan peran lembaga-lembaga tersebut diharapkan dapat memutus rantai penularan virus Covid-19 sehingga kita dapat beraktivitas seperti sediakala.
