Hal mengejutkan terjadi di awal balapan. Valentino Rossi dari Ducati yang start dari posisi ke-7 harus merelakan tidak finish di seri Motegi ini. Pada tikungan pertama lap pertama, Rossi bersenggolan dengan Ben Spies yang menyebabkan motor oleng dang tersungkur keluar lintasan. Beruntung bagi Ben Spies masih bisa melanjutkan balapan.
Kejutan juga datang dari dua pembalap muda asal Italy, yakni Andrea Dovisiozo dan Marco Simoncelli yang terkena penalty karena melakukan jump start. Dua pembalap muda Italy ini mendahului start bersama pembalap Yamaha Tech 3, Cal Crutclow. Satu lagi kejutan datang dari sang pemuncak klasemen, Casey Stoner yang pada balapan seri ini mengawali start dari pole position. Hingga lap-lap awal Stoner pun masih memimpin jalannya lomba, tapi sayang pada lap ke-4 laju motor Stoner keluar lintasan, beruntung masih bisa dikendalikan dan bisa kembali lagi ke lintasan. Saat di lintasan, Stoner menduduki posisi ke-5, sementara pimpinan lomba dipegang oleh rekan satu timnya, Dani Pedrosa.
(update : lap 9)
