Sebagai tokoh nasionalis, Haidar Alwi terus berupaya mengedukasi masyarakat tentang bahaya dari radikalisme dan intoleransi bagi keutuhan Negara Kesatuan Republik Indonesia (NKRI) . Haidar Alwi mengingatkan, aliran intoleransi, radikalisme, hingga terorisme harus dimusnahkan dari bumi NKRI.
Agar kelompok radikal dan intoleran tidak menggerogoti lebih ke dalam lagi, diperlukan upaya nyata untuk memusnahkan semua itu. Tentunya kita tidak menginginkan perubahan apa pun, apalagi mengganti ideologi Pancasila dengan paham lain yang mana bagi sebagian kelompok adalah yang terbaik untuk mereka.
"Yang namanya orang radikal, itu susah sekali diberantas. Maka gerakan ini harus continue. Kalau tidak maka Indonesia akan lewat.
Kita harus minta pemerintah tegas menagani ini . Sebab radikal naik pangkat jadi teroris," imbuhnya
Edukasi melalui diskusi publik dan talk show kebangsaan akan bahaya radikalisme dan intoleransi terus digalakkan oleh Haidar Alwi bersama sejumlah organisasi yang dipimpin olehnya.
Bagi Haidar, para anggota kaum radikalisme , baik dari HTI dan lainnya, mereka tidak mendalami ajaran Rasulallah Muhammad SAW. Ajaran yang benar adalah Islam sebagai rahmatan lil alamin.