Faktor-faktor yang mempengaruhi efektivitas nutrasetika ada berbagai macam seperti kerusakan fisik yakni pengerasan buah kering, pelunakan sereal yang renyah, munculnya mikroba seperti jamur dan sebagainya. Lalu kerusakan kimia yaitu perubahan warna, kehilangan nutrisi, rasa yang berubah dan lain-lain.
Sehingga dari yang dibahas diatas didapat bahwa kerusakan tersebut dapat mengurangi stabilitas atau masa simpan sediaan nutrasetika sehingga efektivitas menurun. Penjelasan lebih lanjut dapat dilihat dibawah terkait faktor apa saja yang memengaruhi stabilitas.
1. Suhu
Suhu yang terlalu panas dapat menyebabkan kerusakan pada sediaan nutrasetika karena suhu yang meningkat menyebabkan laju reaksi meningkat sehingga mempercepat reaksi mikroba. Maka disarankan disimpan dalam suhu dingin atau kulkas.
2. Kelembapan
Kelembapan suatu produk harus dijaga sebab jika terlalu lembab dapat menyebabkan mikroba mudah berkembang sehingga kadar lembab sediaan harus dijaga.
3. Oksigen
Beberapa bahan seperti lemak atau yang berminyak sensitif dengan oksigen seperti minyak kelapa, minyak makan dan lain-lain sehingga dapat menyebabkan minyak tersebut mengalami oksidasi dengan tanda memiliki aroma tengik. Sehingga untuk mengatasi hal ini dapat diberikan wadah yang tertutup rapat sehingga oksidasi dapat dicegah.
4. Bahan tambahan
Bahan tambahan ada berbagai macam seperti pemanis, perasa, pewarna dan pengawet. Ada beberapa bahan tambahan yang tidak cocok dengan bahan utama yang digunakan seperti pemanis Tagatose bereaksi dengan amina atau gugus karbonil (Buah-buahan) menyebabkan penurunan masa simpan, pencoklatan dan rasa tidak enak yang dapat menyebabkan tidak efektif lagi sediaan nutrasetika yang dikonsumsi.
